Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tubb6Q922F4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tubb6Q922F4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms