Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smarca5Q91ZW3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Smarca5Q91ZW3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms