Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atl3Q91YH5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atl3Q91YH5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms