Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrna2Q91X60 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna2Q91X60 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms