Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tdrd3Q91W18 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tdrd3Q91W18 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms