Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Capn8Q91VA3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn8Q91VA3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms