Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3aQ8VHT7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms