Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SelenomQ8VHC3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SelenomQ8VHC3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms