Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ1

Ptgr2, Prostaglandin reductase 2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgr2Q8VDQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Ptgr2Q8VDQ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptgr2Q8VDQ1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms