Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ApobrQ8VBT6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApobrQ8VBT6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms