Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W7

Agr3, Anterior gradient protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agr3Q8R3W7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Agr3Q8R3W7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Agr3Q8R3W7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms