Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc58Q8R3Q6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccdc58Q8R3Q6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc58Q8R3Q6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc58Q8R3Q6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc58Q8R3Q6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc58Q8R3Q6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc58Q8R3Q6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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