Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slf1Q8R3P9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slf1Q8R3P9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slf1Q8R3P9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slf1Q8R3P9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slf1Q8R3P9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms