Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ccdc12Q8R344 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc12Q8R344 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms