Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r200Q8R281 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r200Q8R281 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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