Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg10Q8R1P4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg10Q8R1P4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms