Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RorbQ8R1B8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RorbQ8R1B8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms