Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sf3b4Q8QZY9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sf3b4Q8QZY9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms