Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casc3Q8K3W3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casc3Q8K3W3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casc3Q8K3W3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casc3Q8K3W3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casc3Q8K3W3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casc3Q8K3W3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casc3Q8K3W3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Casc3Q8K3W3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casc3Q8K3W3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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