Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MyripQ8K3I4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MyripQ8K3I4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms