Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cdk5rap2Q8K389 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5rap2Q8K389 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5rap2Q8K389 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms