Protein–RNA interactions for Protein: Q8K368

Fanci, Fanconi anemia group I protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanciQ8K368 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FanciQ8K368 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FanciQ8K368 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms