Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ncapd2Q8K2Z4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ncapd2Q8K2Z4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ncapd2Q8K2Z4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms