Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf39Q8K2Z2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf39Q8K2Z2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms