Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccm2Q8K2Y9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccm2Q8K2Y9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms