Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hacd3Q8K2C9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms