Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pacs1Q8K212 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pacs1Q8K212 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms