Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
1700001C19RikQ8K168 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
1700001C19RikQ8K168 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms