Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FgbQ8K0E8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FgbQ8K0E8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FgbQ8K0E8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FgbQ8K0E8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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FgbQ8K0E8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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FgbQ8K0E8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FgbQ8K0E8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms