Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbrd1Q8K0B2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmbrd1Q8K0B2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmbrd1Q8K0B2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmbrd1Q8K0B2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms