Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Pkn3Q8K045 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Pkn3Q8K045 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkn3Q8K045 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pkn3Q8K045 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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