Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afg3l2Q8JZQ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms