Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TwnkQ8CIW5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TwnkQ8CIW5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms