Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nupl2Q8CIC2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nupl2Q8CIC2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms