Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NgefQ8CHT1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NgefQ8CHT1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NgefQ8CHT1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms