Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh4a1Q8CHT0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh4a1Q8CHT0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh4a1Q8CHT0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh4a1Q8CHT0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh4a1Q8CHT0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh4a1Q8CHT0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh4a1Q8CHT0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Aldh4a1Q8CHT0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Aldh4a1Q8CHT0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms