Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nav1Q8CH77 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nav1Q8CH77 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nav1Q8CH77 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms