Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Upp2Q8CGR7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Upp2Q8CGR7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms