Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE6

Slc38a2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a2Q8CFE6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Slc38a2Q8CFE6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc38a2Q8CFE6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a2Q8CFE6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a2Q8CFE6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc38a2Q8CFE6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a2Q8CFE6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a2Q8CFE6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms