Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc178Q8CDV0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc178Q8CDV0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms