Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8CDS7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms