Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
4930507D05RikQ8C9C9 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms