Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfibp1Q8C8U0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms