Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ccdc113Q8C5T8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ccdc113Q8C5T8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ccdc113Q8C5T8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ccdc113Q8C5T8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ccdc113Q8C5T8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ccdc113Q8C5T8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ccdc113Q8C5T8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Ccdc113Q8C5T8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Ccdc113Q8C5T8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc113Q8C5T8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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