Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cwc22Q8C5N3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cwc22Q8C5N3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms