Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Ctdsp2Q8BX07 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Ctdsp2Q8BX07 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Ctdsp2Q8BX07 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctdsp2Q8BX07 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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