Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWU1

Sprn, Shadow of prion protein, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprnQ8BWU1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SprnQ8BWU1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms