Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TtpaQ8BWP5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TtpaQ8BWP5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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