Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Ssc5dQ8BV57 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Ssc5dQ8BV57 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ssc5dQ8BV57 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Ssc5dQ8BV57 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssc5dQ8BV57 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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