Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubr7Q8BU04 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms